Есть факты, подтверждающие, что исторические и культурные корни Консерватории Санта-Чечилия в Риме восходят к древнейшей группе музыкантов Vertuosa, а с 1565 года — к Конгрегации римских музыкантов под покровительством Св. Цецилии (небесной покровительницы музыки), которая стала Академией, сначала Папской, затем королевской и, наконец, определила себя в качестве Национальной академии Санта-Чечилия. Конгрегация зарекомендовала себя в качестве важнейшего института в деле подготовки римских музыкантов. Благодаря различным Папским концессиям, для того, чтобы работать в Папской области в качестве хормейстера, необходимо было сдать экзамен в Конгрегации. Помимо этого, запрещалось исполнять музыку, не одобренную самой Конгрегацией.

С первых десятилетий XIX века возникла необходимость в создании музыкальной школы. В годы правления Гаспара Спонтини (1839-1840) эта идея могла бы реализоваться благодаря престижу композитора, назначенного директором школы, но скептицизм, проявленный властями Папского правительства, помешал осуществлению задуманного.

Первое ядро музыкальной школы было заложено Джованни Сгамбати, всемирно известным пианистом и композитором, который не только являлся учеником Листа, но и сам был великим учителем. Сгамбати получил в Академии место, позволяющее проводить бесплатный курс фортепиано. Кроме того, предусматривались резервные места для талантливых учеников с низким уровнем дохода. Примеру Сгамбати последовал Этторе Пинелли, который в свою очередь ввел бесплатный курс скрипки. Это было в 1869 году, а уже 23 мая следующего года кардинал Camillo Di Pietro официально постановил открыть две школы с десятью студентами в каждой, при этом набор в них мог быть увеличен в зависимости от количества запросов. Именно с 23 мая 1870 г. начинается славная история музыкального института.

[…] В 1886 году Королевским указом было утверждено положение, вводившее преподавание в музыкальном лицее следующих дисциплин: композиция, пение, орган, фортепиано, скрипка, альт, виолончель, контрабас, флейта, гобой, кларнет, фагот, валторна, труба, тромбон, арфа, ударные инструменты, теория музыки, история и эстетика музыки, права и пошлины, декламация и жест, поэтика и драматическая литература, итальянский язык, латинский язык и арифметика, французский и другие иностранные языки, география и история, музыкальная палеография. В общей сложности насчитывалось 43 преподавателя и 315 студентов. В течение первых 25 лет в лицее обучалось 1 595 студентов, в то время как количество отчисленных составило 443 человека.

В 1893 году Школа декламации и жеста под руководством Virginia Marini отделилась от лицея, став школой » Eleonora Duse «. Именно она в 1935 г. дала жизнь нынешней Национальной академии драматического искусства, президентство которой было поручено Silvio d’Amico. После смерти великого историка и театрального критика Академия названа его именем.

Лицей нуждался в большом зале для проведения академических мероприятий, концертов и экзаменов, вот почему в 1881 году архитектору Pompeo Coltellacci был предоставлен мандат для разработки «проекта, основанного на лучшем, что существует в этом жанре в главных столицах». Здание предполагалось построить на месте сада бывшего монастыря. Уже в 1895 году королевой Маргаритой, лично выделившей 10 000 лир для финансирования работ, Академический зал был торжественно открыт. С 795 кв. метрами и высотой 14 метров это был самый вместительный концертный зал в Риме с совершенной акустикой; здесь установили большой орган, выпущенный фирмой E. F. Walcker di Wuttemberg. В целом, академический зал мог вместить около 1 200 зрителей. На подмостках этой престижной сцены еще тридцать лет назад на концертах Академии выступали величайшие музыканты того времени; здесь же свои первые шаги делали лучшие студенты лицея и консерватории.
В 1911 году музыкальный лицей превратился в автономную организацию (L.9.2.11 127), а в 1919 году выделился из состава Академии и официально стал независимым государственным учреждением культуры(L.22.8.19 227). С постановлением о реорганизации художественных учебных заведений (DL.11.12.23 n.2123) он получил свое нынешнее название — Консерватория Санта-Чечилия.

С 2009 года началась интенсивная работа с местными органами власти и с соответствующими учреждениями с целью найти здание, в котором будет располагаться Консерватория. Выбор пал на здание бывших королевских казарм S.Andrea delle Fratte, расположенное в историческом центре города, неподалеку от Испанской лестницы, в нескольких минутах ходьбы от Консерватории. Комплекс занял площадь в 1 600 кв. метров и насчитывал 30 аудиторий.

С 2010 года начинается процесс приобретения офиса, принадлежащего военному ведомству Итальянского государства, и лишь в 2012 году появляются первые положительные результаты. Так, с разрешения Министерства обороны, собственника здания, 27 июня 2013 г. был, наконец, подписан договор с Агентством государственного имущества о бесплатной передаче строения в собственность консерватории.

После вступления в силу закона от 1 октября 2013 года в S.Andrea delle Fratte началась образовательная деятельность (2012-2013 учебный год).